Circunscripciones
La CEDQ se divide en seis circunscripciones en las que se agrupan todas las universidades que forman la conferencia.
Centro - Canarias
Alcalá, UNED, Complutense de Madrid, Autónoma de Madrid, Castilla la Mancha y La Laguna.

Cataluña
Barcelona, Autónoma de Barcelona, Ramón Llull, Girona y Rovira i Virgili.

Levante - Baleares
Alicante, Castellón, Murcia, Islas Baleares y Valencia.

Andalucía - Extremadura
Almería, Cádiz, Córdoba, Granada, Huelva, Jaén, Málaga, Sevilla y Extremadura.

Galicia - Castilla y León
Santiago, La Coruña, Vigo, Burgos, Salamanca y Valladolid.

Norte - Ebro
UPV-Bilbao, UPV-San Sebastián, Oviedo, La Rioja, Navarra y Zaragoza.